Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV5

PRDM11, PR domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11Q9NQV5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM11Q9NQV5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM11Q9NQV5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms