Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms