Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FANCFQ9NPI8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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