Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNRC6CQ9HCJ0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms