Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms