Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms