Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms