Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms