Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms