Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSDMCQ9BYG8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms