Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4AQ9BY43 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms