Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms