Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms