Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms