Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms