Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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