Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms