Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms