Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms