Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms