Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms