Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms