Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms