Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms