Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELBQ8NG08 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms