Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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