Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms