Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLDN19Q8N6F1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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