Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms