Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC83Q8IWF9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms