Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms