Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms