Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms