Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms