Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF18Q5VWM3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms