Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf53Q5VUE5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms