Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms