Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms