Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms