Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2CD3Q4AC94 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms