Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NBPF1Q3BBV0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms