Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA3Q16787 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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