Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HIST3H3Q16695 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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