Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CTF1Q16619 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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