Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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