Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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