Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR6A1Q15406 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms