Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms