Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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