Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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